Les origines du Bouvier des Flandres comme son nom l'indique sont aussi bien belges que françaises, aucune frontière ne séparant ces deux contrées.
Il est difficile de déterminer avec certitude ses origines, produit sans doute issu d'accouplements réalisés au hasard des circonstances.

Ce qui est certain, c'est que les bergers ou toucheurs de bestiaux des Flandres qui, pour conduire leurs troupeaux, avez besoin de bons chiens, sélectionnaient ceux dont ils disposaient dans leur région, d'avantage sur leurs qualités morales et physiques, dont le Bouvier des Flandres actuel a hérité, qu'en considération d'un type bien déterminé.

Le Bouvier des Flandres semblerait donc être la résultante finale de croisements indéterminés et divers entre chiens parfaitement robustes et rustiques. Cette sélection qualitative a donné en fin de compte, à ces chiens une certaine homogénéité qui attira l'attention des cynologues, lesquels purent, en 1912, établirent un premier standard.

Pour maintenir la fixité du type de nos jours établi, ainsi que la pureté de la race, il est nécessaire que soient éliminés radicalement de l'élevage tous les sujets présentant des défauts de caractère récessif, aussi bien physiques que moraux, venant d'héritage de leurs ancêtres lointains aux type indéterminé.

A l'origine le Bouvier des Flandres était employé comme conducteur de troupeaux, comme chien de trait et de baratte. La modernisation de l'équipement des fermes a modifié l'utilisation première et, de nos jours, le Bouvier des Flandres sert surtout de chien de garde pour la propriété et la ferme, de chien de défense et de police.
Ses aptitudes physiques et morales, ses grandes qualités olfactives, d'initiative et d'intelligence permettent de l'utiliser comme chien de pistage, de liaison ou de contre braconnage.

Grâce à sa force, à son volume et son aspect rébarbatif, du fait de son intelligence, de sa fidélité à son maître et de son attachement à tout ce qui appartient à la famille et au milieu où il vit, le Bouvier est un merveilleux chien de garde.
Il sait défendre avec toute son énergie et son intelligence, la maison, l'usine, le jardin, l'auto. Redoutable gardien, il sait aussi se montrer le défenseur intelligent et le protecteur des enfants de la famille, tout en devenant leur ami et leur camarade de jeux.